گروه گیاه پزشکی فعالیت مستقل و تخصصی خود را در سال 1363 با جدا شدن از رشته علوم زراعی و پذیرش دانشجویان در مقطع کارشناسی آغاز کرد. اولین گروه دانشجویان کارشناسی ارشد در رشته حشره شناسی کشاورزی در سال 1370 پذیرفته شدند. از چند سال بعد رشته بیماری شناسی گیاهی نیز در مقطع کارشناسی ارشد راه اندازی شد. اولین دانشجویان مقطع دکتری حشره شناسی کشاورزی از سال 1383 پذیرفته شدند.
در حال حاضر گروه گیاه پزشکی ده عضو هیات علمی فعال شامل یک استاد، شش دانشیار و سه استادیار در تخصص های اکولوژی حشرات، کنترل بیولوژیک و مدیریت آفات و بیماری های گیاهی، سیستماتیک حشرات و کنه ها، سموم شیمیایی، قارچ شناسی، ویروس شناسی و نماتودشناسی گیاهی است.