گروه گیاه پزشکی فعالیت مستقل و تخصصی خود را در سال 1363 با جدا شدن از رشته علوم زراعی و پذیرش دانشجویان در مقطع کارشناسی آغاز کرد. اولین گروه دانشجویان کارشناسی ارشد در رشته حشره شناسی کشاورزی در سال 1370 پذیرفته شدند. از چند سال بعد رشته بیماری شناسی گیاهی نیز در مقطع کارشناسی ارشد راه اندازی شد. اولین دانشجویان مقطع دکتری حشره شناسی کشاورزی از سال 1383 پذیرفته شدند.
در حال حاضر گروه گیاه پزشکی 9 عضو هیات علمی فعال شامل دو استاد، هفت دانشیار، در تخصص های اکولوژی حشرات، کنترل بیولوژیک، فیزیولوژی حشرات، مدیریت آفات و بیماری های گیاهی، سیستماتیک حشرات و کنه ها، سم شناسی، قارچ شناسی، ویروس شناسی گیاهی را داراست.
